Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX35

Eda2r, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 27, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eda2rQ8BX35 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Eda2rQ8BX35 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eda2rQ8BX35 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms