Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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