Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx17Q8BVL3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx17Q8BVL3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx17Q8BVL3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx17Q8BVL3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx17Q8BVL3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx17Q8BVL3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx17Q8BVL3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx17Q8BVL3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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