Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BP99 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BP99 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BP99 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BP99 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BP99 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BP99 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BP99 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BP99 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BP99 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BP99 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BP99 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BP99 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BP99 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BP99 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BP99 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BP99 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BP99 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BP99 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BP99 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BP99 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BP99 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BP99 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BP99 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BP99 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BP99 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BP99 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BP99 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BP99 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BP99 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BP99 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BP99 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BP99 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BP99 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BP99 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BP99 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BP99 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BP99 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BP99 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BP99 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BP99 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BP99 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BP99 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BP99 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BP99 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BP99 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BP99 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BP99 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BP99 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BP99 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BP99 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BP99 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BP99 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BP99 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BP99 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BP99 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BP99 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BP99 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BP99 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BP99 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BP99 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BP99 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BP99 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BP99 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BP99 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BP99 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BP99 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BP99 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BP99 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BP99 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BP99 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BP99 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BP99 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BP99 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BP99 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BP99 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BP99 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BP99 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BP99 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BP99 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BP99 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BP99 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BP99 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BP99 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BP99 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BP99 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BP99 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BP99 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BP99 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BP99 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BP99 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BP99 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BP99 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8BP99 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8BP99 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8BP99 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8BP99 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8BP99 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8BP99 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8BP99 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms