Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms