Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms