Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms