Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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