Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Lrfn4Q80XU8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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