Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

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Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma8aQ80VM8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms