Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms