Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms