Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdp1Q7TSG2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms