Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms