Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms