Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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