Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ncapd3Q6ZQK0 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms