Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms