Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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