Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms