Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms