Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gapvd1Q6PAR5 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gapvd1Q6PAR5 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms