Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smchd1Q6P5D8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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