Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D4

Cep135, Centrosomal protein of 135 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep135Q6P5D4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Cep135Q6P5D4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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Cep135Q6P5D4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Cep135Q6P5D4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Cep135Q6P5D4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Cep135Q6P5D4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Cep135Q6P5D4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep135Q6P5D4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms