Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms