Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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