Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms