Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt77Q6IFZ6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt77Q6IFZ6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt77Q6IFZ6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt77Q6IFZ6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt77Q6IFZ6 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt77Q6IFZ6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt77Q6IFZ6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt77Q6IFZ6 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt77Q6IFZ6 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt77Q6IFZ6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt77Q6IFZ6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt77Q6IFZ6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Krt77Q6IFZ6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt77Q6IFZ6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Krt77Q6IFZ6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt77Q6IFZ6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Krt77Q6IFZ6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt77Q6IFZ6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt77Q6IFZ6 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt77Q6IFZ6 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Krt77Q6IFZ6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt77Q6IFZ6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Krt77Q6IFZ6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt77Q6IFZ6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt77Q6IFZ6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt77Q6IFZ6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt77Q6IFZ6 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt77Q6IFZ6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt77Q6IFZ6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt77Q6IFZ6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt77Q6IFZ6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt77Q6IFZ6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt77Q6IFZ6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt77Q6IFZ6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt77Q6IFZ6 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Krt77Q6IFZ6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Krt77Q6IFZ6 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Krt77Q6IFZ6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt77Q6IFZ6 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt77Q6IFZ6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt77Q6IFZ6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Krt77Q6IFZ6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Krt77Q6IFZ6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt77Q6IFZ6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Krt77Q6IFZ6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt77Q6IFZ6 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt77Q6IFZ6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt77Q6IFZ6 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt77Q6IFZ6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt77Q6IFZ6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt77Q6IFZ6 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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