Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms