Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6DFW0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6DFW0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6DFW0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6DFW0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Q6DFW0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6DFW0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6DFW0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6DFW0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6DFW0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6DFW0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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