Protein–RNA interactions for Protein: Q6A028

Swap70, Switch-associated protein 70, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swap70Q6A028 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Swap70Q6A028 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms