Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp4eQ66X19 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms