Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Top2bQ64511 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Top2bQ64511 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms