Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pan3Q640Q5 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms