Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc18Q640L5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
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