Protein–RNA interactions for Protein: Q62460

Gm20865, (clone BALB3N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20865Q62460 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gm20865Q62460 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gm20865Q62460 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gm20865Q62460 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gm20865Q62460 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gm20865Q62460 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gm20865Q62460 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gm20865Q62460 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gm20865Q62460 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Gm20865Q62460 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Gm20865Q62460 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Gm20865Q62460 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Gm20865Q62460 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Gm20865Q62460 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20865Q62460 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms