Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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Hoxa13Q62424 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Hoxa13Q62424 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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Hoxa13Q62424 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxa13Q62424 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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Hoxa13Q62424 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Hoxa13Q62424 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Hoxa13Q62424 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
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Hoxa13Q62424 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Hoxa13Q62424 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Hoxa13Q62424 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Hoxa13Q62424 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
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Hoxa13Q62424 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms