Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ss18Q62280 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ss18Q62280 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ss18Q62280 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ss18Q62280 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ss18Q62280 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ss18Q62280 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
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