Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ssr4Q62186 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ssr4Q62186 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ssr4Q62186 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ssr4Q62186 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ssr4Q62186 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ssr4Q62186 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ssr4Q62186 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ssr4Q62186 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ssr4Q62186 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ssr4Q62186 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssr4Q62186 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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