Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Lrrn1Q61809 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Lrrn1Q61809 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Lrrn1Q61809 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Lrrn1Q61809 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Lrrn1Q61809 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Lrrn1Q61809 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Lrrn1Q61809 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Lrrn1Q61809 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Lrrn1Q61809 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Lrrn1Q61809 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Lrrn1Q61809 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Lrrn1Q61809 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Lrrn1Q61809 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lrrn1Q61809 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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