Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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Cd47Q61735 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Cd47Q61735 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Cd47Q61735 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Cd47Q61735 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Cd47Q61735 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Cd47Q61735 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Cd47Q61735 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Cd47Q61735 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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Cd47Q61735 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Cd47Q61735 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Cd47Q61735 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cd47Q61735 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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