Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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Cd53Q61451 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd53Q61451 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd53Q61451 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd53Q61451 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd53Q61451 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd53Q61451 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Cd53Q61451 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Cd53Q61451 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd53Q61451 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd53Q61451 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Cd53Q61451 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd53Q61451 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd53Q61451 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Cd53Q61451 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd53Q61451 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd53Q61451 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd53Q61451 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd53Q61451 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd53Q61451 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Cd53Q61451 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cd53Q61451 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Cd53Q61451 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cd53Q61451 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Cd53Q61451 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Cd53Q61451 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Cd53Q61451 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Cd53Q61451 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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