Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Foxd1Q61345 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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Foxd1Q61345 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd1Q61345 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Foxd1Q61345 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Foxd1Q61345 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Foxd1Q61345 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Foxd1Q61345 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Foxd1Q61345 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Foxd1Q61345 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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Foxd1Q61345 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Foxd1Q61345 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Foxd1Q61345 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd1Q61345 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd1Q61345 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Foxd1Q61345 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd1Q61345 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd1Q61345 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd1Q61345 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd1Q61345 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd1Q61345 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd1Q61345 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd1Q61345 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd1Q61345 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd1Q61345 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd1Q61345 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd1Q61345 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd1Q61345 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd1Q61345 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd1Q61345 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd1Q61345 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd1Q61345 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd1Q61345 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd1Q61345 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd1Q61345 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd1Q61345 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd1Q61345 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd1Q61345 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd1Q61345 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd1Q61345 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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