Protein–RNA interactions for Protein: Q61187

Tsg101, Tumor susceptibility gene 101 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsg101Q61187 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsg101Q61187 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms