Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cln3Q61124 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Cln3Q61124 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Cln3Q61124 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Cln3Q61124 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cln3Q61124 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cln3Q61124 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cln3Q61124 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cln3Q61124 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Cln3Q61124 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Cln3Q61124 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms