Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NinQ61043 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NinQ61043 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NinQ61043 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NinQ61043 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NinQ61043 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NinQ61043 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NinQ61043 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NinQ61043 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NinQ61043 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NinQ61043 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NinQ61043 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NinQ61043 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NinQ61043 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NinQ61043 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NinQ61043 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NinQ61043 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NinQ61043 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NinQ61043 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NinQ61043 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NinQ61043 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NinQ61043 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NinQ61043 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NinQ61043 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NinQ61043 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NinQ61043 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NinQ61043 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NinQ61043 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NinQ61043 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NinQ61043 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NinQ61043 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NinQ61043 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NinQ61043 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NinQ61043 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NinQ61043 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NinQ61043 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NinQ61043 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NinQ61043 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NinQ61043 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NinQ61043 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NinQ61043 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NinQ61043 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NinQ61043 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NinQ61043 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NinQ61043 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NinQ61043 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NinQ61043 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NinQ61043 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NinQ61043 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NinQ61043 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NinQ61043 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NinQ61043 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NinQ61043 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NinQ61043 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NinQ61043 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NinQ61043 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NinQ61043 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NinQ61043 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NinQ61043 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NinQ61043 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NinQ61043 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NinQ61043 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NinQ61043 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NinQ61043 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NinQ61043 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NinQ61043 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NinQ61043 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NinQ61043 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NinQ61043 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NinQ61043 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NinQ61043 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NinQ61043 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NinQ61043 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NinQ61043 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NinQ61043 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NinQ61043 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NinQ61043 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NinQ61043 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NinQ61043 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NinQ61043 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NinQ61043 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NinQ61043 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NinQ61043 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NinQ61043 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NinQ61043 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NinQ61043 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NinQ61043 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NinQ61043 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NinQ61043 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NinQ61043 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NinQ61043 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NinQ61043 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NinQ61043 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NinQ61043 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NinQ61043 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NinQ61043 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NinQ61043 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NinQ61043 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NinQ61043 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NinQ61043 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms