Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms