Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms