Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms