Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms